Diese dreieckige Schiffsdesign ist nun mal ein gängies im Star Wars Universum und wurde von verschiedenen Seiten zu verschiedenen Zeiten genutzt.
Die Dinger hier aus Kotor zum Beispiel:
http://images3.wikia.nocookie.net/__cb20090404133832/starwars/images/thumb/9/9b/Ravager5.jpg/830px-Ravager5.jpg
Das waren erst republikanische Schiffe, aber die wurden dann später auch im Bürgerkrieg von Revan und Malak verwendet. Schließlich hatten die ihre ersten Schiffe (also vor der Aktivierung der Sternenschmiede) einfach von der Republik geklaut.
Und was die Sache mit der Republik und dem Imperium zur Zeit der Filme angeht:
zunächst mal haben die Klontruppen wenig bis gar nichts mit der republikanischen Flotte zu tun. Die Schiffe und deren Besatzungen gab es ja auch schon vor den Klonkriegen. Nur wurden währendessen auch noch neue Schiffstypen entwickelt oder bestehende verbessert.
So wurden das Venator Schlachtschiff von der selben Frau entwickelt, die auch den imperialen Sternenzerstörer konstruiert hat.
http://images3.wikia.nocookie.net/__cb20080121044251/starwars/images/thumb/3/3f/Venator_Class_Star_Destroyer_CS.jpg/830px-Venator_Class_Star_Destroyer_CS.jpg
Ihr Vater hatte übrigens die Dinger gebaut:
http://images3.wikia.nocookie.net/__cb20061122004726/starwars/images/2/2c/Vsd1-eaw.jpg
Und es ist klar, dass das Imperium nach den Klonkriegen nicht die gesamte Flotte verschrottet hat, sondern die Schiffe behalten und zusätzlich neue, bessere entwickeln ließ. Die republikanische Flotte wurde ja zur imperialen Flotte und nicht durch diese ersetzt.