Je confirme, il est possible de détruire les vaisseaux mères des différentes missions sans avoir besoin des "Torpilles à proton".
Je ne saurais dire exactement le nombre qu'il en faut, mais je conseille d'en envoyer à chaque fois que la cible du vaisseaux mères est visible (sans omettre de faire la mission principale et les bonus). Ce qui permet d'avoir une bonne avance pour pouvoir le détruire à la fin de la mission.
Par contre, d'après ce que j'ai pu constater, il n'y a qu'une seule mission où je n'ai pas réussit à détruire le vaisseau mère car le temps de passage n'est pas assez long pour permettre de faire la mission principale et les missions bonus tout en balançant assez de missile pour le détruire ... la rotation des 4 missiles ne le permet pas! (Mais je n'y suis jamais revenu pour tester avec les "torpilles à proton").